Eleccions presidencials de disputa del 2010
A causa del conflicte civil i de les seves conseqüències, les eleccions presidencials previstes per al 2005 es van ajornar repetidament durant els propers anys. Quan finalment es va celebrar la primera volta de les eleccions, el 31 d'octubre de 2010, Ouattara era el candidat a RDR. Va guanyar el 32 per cent dels vots, situant el segon per darrere de Gbagbo, que va guanyar el 38 per cent, i els dos van avançar a una segona volta de votacions, celebrada el 28 de novembre del 2010. El 2 de desembre de 2010, la comissió electoral del país va declarar que Ouattara va guanyar les eleccions. amb el 54 per cent dels vots, però l'endemà, el Consell Constitucional va citar el que va dir que evidenciava nombroses irregularitats i va descomptar una part dels resultats. Després va declarar Gbagbo com a guanyador, amb el 51 per cent dels vots.
Ouattara va ser el guanyador legítim de la majoria de la comunitat internacional, inclosa l'ONU, que havia certificat els resultats inicials, i va comptar amb el suport de les tropes rebels que controlaven la zona nord del país. No obstant això, Gbagbo, que va comptar amb el suport de l'exèrcit i dels màxims nivells de govern del país, va ser jurat per un altre mandat com a president. Mentrestant, Ouattara s’havia jurat com a president i va formar un govern paral·lel, amb seu en un hotel Abidjan sota la protecció de les Forces de manteniment de la pau de l’ONU. L'enfrontament polític va despertar temors de que el país tornés a entrar en conflicte civil una altra vegada i la Unió Africana va intentar mediar. Malgrat això, la suspensió va continuar durant mesos i es va tornar violenta a mesura que augmentaven els combats entre forces lleials a Gbagbo i aquelles que donaven suport a Ouattara, creant una crisi de dimensions polítiques, econòmiques i humanitàries que es va perllongar fins i tot després que Gbagbo fos arrestat l'11 d'abril de 2011. i es va eliminar del poder. (Per a més detalls, vegeu Costa d’Ivori: eleccions disputades de 2010 i actitud política prolongada.)
La detenció de Gbagbo va eliminar el repte més immediat a la presidència d'Ouattara. Ouattara va poder aleshores mirar les funcions oneroses de restaurar l’estabilitat econòmica, alleujar la crisi humanitària i reunificar el país, que s’havia mantingut dividit des de la guerra civil 2002-03. També va necessitar fomentar la reconciliació entre els partidaris de Gbagbo i els seus. Amb aquesta finalitat, Ouattara va demanar un cessament dels combats i va prometre formar una comissió de reconciliació de la veritat i la reconciliació per investigar els fets delictius i els abusos dels drets humans presumptament comesos per les dues parts; més tard va demanar que el Tribunal Penal Internacional també investigés la violència de postelecció. Al maig de 2011, el Consell Constitucional va revertir la seva decisió de desembre de 2010 i va reconèixer Ouattara com a guanyador de les eleccions presidencials. Va ser jurat oficialment el 6 de maig, amb una inauguració i celebració pública el 21 de maig.
Com a president, Ouattara va poder fomentar una recuperació econòmica impressionant per al país, tot i que alguns ivoirians es queixaven que el progrés econòmic no s'havia enderrocat prou per ajudar a alleujar la pobresa. També es va criticar que, malgrat els seus compromisos anteriors, Ouattara encara no havia fet prou per abordar la necessitat de reconciliació i justícia arran de la crisi electoral del 2010. Tot i així, Ouattara va ser el primer líder a les eleccions presidencials del 25 d'octubre de 2015 Tot i que alguns candidats a l'oposició s'havien retirat de les eleccions i van demanar un boicot, més del 50 per cent dels electors es van presentar, i Ouattara va ser reelegit amb gairebé el 84 per cent dels vots.
