El segell de Nova Hampshire es va adoptar el 1784 després de la Guerra Revolucionària. El 28 de desembre de 1792, la legislatura va adoptar un reglament que requeria que els regiments de la milícia estatal portessin la bandera nacional i els colors regimentals amb el segell d'estat. Passà, però, més d’un segle abans de l’adopció d’una bandera estatal amb finalitats generals. La llei de bandera de 1909 preveia un fons blau que portava el segell d'estat al centre, emmarcat per una corona de llorer amb nou estrelles intercalades, el que significa el rang de Nova Hampshire com el novè estat per ratificar la Constitució dels Estats Units.
El segell, que va ser lleugerament modificat el 1931, presenta la fragata Raleigh construïda a Portsmouth. Tot i que la nau va ser construïda el 1776, el segell la mostra volant banderes que no es van adoptar fins al 1777.