Hi ha dues fonts per als colors blanc-blau-vermell de la bandera nacional eslovena. Per la seva bandera ètnica nacional, Eslovènia havia adoptat una còpia de la bandera russa per mostrar la seva solidaritat amb els altres pobles eslaus en el moment de les Guerres Napoleòniques. Tanmateix, abans, però, el Sant emperador romà havia concedit un escut a la "Corona de Carniola", que aleshores formava part de l'imperi. Aquest escut comptava amb un escut blanc que portava una àguila blava amb un creixent vermell i blanc al seu pit. Un altre escut important de la història eslovena va ser el que va utilitzar el comtat de Celje: un escut blau amb tres estrelles grogues. Finalment, sota el règim comunista del segle XX, l’escut d’Eslovènia tenia línies horitzontals ondulades blaves i blanques per suggerir la costa del país adriàtic, així com una muntanya estilitzada de tres cims, la més alta d’Eslovènia, el famós Triglav.
Eslovènia va proclamar la seva independència el 25 de juny de 1991, però va haver de lluitar contra l'exèrcit iugoslau per establir-ne la sobirania. La bandera que es va aixecar el Dia de la Independència era el tradicional tricolor pan-eslau blanc-blau-vermell. Per distingir-la de les banderes similars de Rússia i Eslovàquia, el nou escut d’Eslovènia es va afegir al cantó superior del polipast sobreposat a les ratlles blanques i blaves. L'escut presenta una combinació de les ratlles Triglav i ondulades dels braços comunistes amb les estrelles grogues sobre un fons blau de l'escut de Celje.
