Segons el sistema de tutela de les Nacions Unides creat després de la Segona Guerra Mundial, els francesos tenien l'obligació de dirigir Togo cap a l'autogovern. Es va adoptar una bandera local el 1956, poc abans que es convertís el país en una república autònoma dins de la Unió Francesa. El fons verd de la bandera era l'agricultura, l'esperança i la joventut; el tricolor francès a la cantonada superior era un record de la dominació francesa. Dues estrelles grogues de cinc puntes, disposades en una línia en diagonal imaginària que va des del polipoll inferior fins a la mosca superior, es referien a les planes litorals del sud i a les sabanes del nord, "units per amor a l'ordre i al treball."
El 27 d'abril de 1960, Togo es va independitzar sota una bandera completament nova; va reduir les dues estrelles a una per tal de remarcar la unitat nacional. Les cinc franges verdes i grogues de la bandera corresponen a les regions administratives del país, mentre que aquests colors són un recordatori que la gran majoria de la població depèn de la terra per al seu sosteniment (verd) i la seva pròpia mà d’obra per al desenvolupament (groc). Es diu que el cantó vermell significa amor, fidelitat i caritat, mentre que l'estrella blanca s'associa a la puresa. Alguns altres països que van obtenir la independència poc abans o després del Togo van seleccionar els mateixos colors roent-groc-verd pan-africà.
