El cromòfor, un grup d’àtoms i electrons que formen part d’una molècula orgànica que fa que es coloregi.
Les relacions entre les característiques estructurals dels compostos químics i els seus colors es busquen des del 1870, quan es va notar que les quinones i els compostos azo i aromàtics sovint són molt acolorits i que els colors es disminueixen o es destrueixen quan els compostos són hidrogenats. La capacitat d’un compost per agafar hidrogen, anomenada insaturació, és causada per la presència d’electrons que no estan fixats fortament en enllaços covalents entre parells d’àtoms particulars sinó que ocupen regions més grans d’espai (orbitals moleculars) que poden estar associats a diversos àtoms.. Aquests electrons poden absorbir energia de la llum en un rang de longituds d’ona de la regió visible; la transmissió o el reflex de la resta de la llum dóna lloc al color observat del compost. La coloració profunda produeix si diversos cromòfors estan units en una mateixa molècula o si hi ha un altre grup, anomenat auxocrom.
