Viatges a l'estranger i canvi d'estil.
Al tombant del segle XVIII, Fischer es trobava a l’altura de la seva carrera. En un signe visible del seu èxit com a arquitecte de cort, es va elevar a la noblesa el 1696. L’aliança imperial amb Prússia, Holanda i Anglaterra durant la Guerra de Successió espanyola va permetre a Fischer, el 1704, visitar aquests països i estudiar la seva arquitectura, particularment en relació amb Palladio. El resultat va ser un canvi notable en el seu estil arquitectònic. El 1707 va anar a Venècia per estudiar l'arquitectura palladiana a la seva font. El resultat va ser el desenvolupament d’un nou tipus de façana del palau “palladí”, clàssica en les seves proporcions i amenitzat amb una decoració ricament esculpida. Consisteix en una projecció central accentuada per un ordre gegant i sobrepassada per un frontó triangular i de seccions laterals relativament poc articulades. Els seus models van ser interpretacions del barroc anglès i nord-alemany de l'arquitectura palladiana, així com les obres del mateix Palladio i dels seus seguidors italians. Els principals èxits de Fischer en aquest camp són les façanes de la Cancelleria de Bohèmia (1708–14) i del palau Trautson (1710–16), ambdues a Viena, i del Palau Clam-Gallas (començat el 1713), a Praga, que van ser imitades per arquitectes de tot l’imperi Habsburg.
Durant els primers deu anys del segle XVIII, Fischer va dissenyar menys edificis que els anys anteriors. El seu temps va ser ocupat per les seves funcions administratives com a inspector en cap dels edificis dels tribunals i el seu treball sobre una gran història de l'arquitectura, l'Entwurf einer historischen Architektur. El seu llibre, que revela l’ampli ventall del seu aprenentatge, va ser la primera història comparativa de l’arquitectura de tots els temps i de totes les nacions; va incloure exemplars significatius d’arquitectura egípcia, persa, grega, romana, musulmana, índia i xinesa, il·lustrats per gravats amb notes explicatives. Algunes de les reconstruccions arqueològiques aparegudes al llibre es van trobar entre les millors de l’època de Fischer. Al final de la prospecció històrica va situar els seus propis èxits, que va veure com una continuació lògica de la tradició romana de l'arquitectura. El llibre es va publicar el 1721.
Projectes finals.
Quan el seu segon mecenes imperial, Josep I, va morir el 1711, la posició de Fischer com a arquitecte principal a la cort vienesa va deixar de ser incontestada. Molts preferien l'arquitectura més agradable i menys exigent del seu rival Johann Lucas von Hildebrandt a les altes concepcions de Fischer. Tot i així, també va aconseguir guanyar el favor de Carles VI, a qui va dedicar la seva història de l'arquitectura en manuscrit el 1712, i obtenir la comissió per a la construcció de la Karlskirche (Església de Sant Carles Borromeo; començada el 1715).
Charles s’havia compromès a construir la Karlskirche com a ofrena al seu patró per l’alliberament de la ciutat d’una epidèmia de la pesta. En la seva grandesa imperial, l'edifici Fischer no només es glorificava a Sant Carles, sinó que també era un monument al mateix emperador. En aquesta església va intentar incorporar i harmonitzar les idees principals contingudes en els edificis sagrats més importants del passat i del present, començant pel temple de Jerusalem i incloent-hi el Panteó i Sant Pere de Roma, la Santa Sofia de Istanbul, i també la Dôme des Invalides a París i St. Paul's a Londres. Les parts relativament independents de l’edifici —un parell de columnes triomfals romanes, torres baixes, una cúpula alta ovalada, un pòrtic modelat després d’una façana del temple romà, un transsepte i un presbiteri— s’harmonitzen per formar una unitat visual des de qualsevol punt que siguin. vist. La complexa estructura formal i simbòlica de l’edifici és el resultat de la seva doble funció. Per exemple, la característica més sorprenent de l'església, la parella de columnes triomfals gegants a banda i banda del pòrtic, està decorada amb relleus en espiral que glorifiquen la vida de Sant Carles. La parella de columnes, però, també al·ludeix a l’emblema de l’emperador, els “pilars d’Hèrcules”.
Fischer no va viure per veure completada la seva obra mestra, però el seu fill Joseph Emanuel Fischer von Erlach va completar l'església amb algunes alteracions. Joseph Emanuel també va completar els estables imperials (1719–23) i va construir, segons els dissenys del seu pare, la Biblioteca Imperial (dissenyada el 1716, construïda el 1723–37), l'interior de la qual era la biblioteca més imponent del seu temps.
